宝德推出科学计算HPC解决方案

大部分科学计算对处理器的浮点运算能力和内存性能要求很高，都属于计算密集型和访存密集型应用。如对于典型的物理和化学计算，计算节点一般选用双路及以上服务器，每个计算节点提供8—24处理器核心，平均每个核心可以配置2—4GB内存。对于一些大型共享式内存并行程序，则推荐采用计算核心更多的SMP胖节点以便获得最佳性能加速比。

宝德针对国内科研院所的科学计算需求，推出了针对物理和化学计算的HPC解决方案。宝德技术专家分析，大部分物理化学软件都是MPI并行程序，并行加速比较好，通常可以扩展到32~128进程以上，程序运行方式通常是跨节点并行运行；从并行算法分析，计算材料软件的进程间通信比较频繁，属于通信密集型应用。因此，节点间网络的延迟和带宽对程序的并行加速比起着决定性的作用。使用传统的千兆以太网很难发挥程序的并行性能，跨节点运行时会导致严重的性能下降，成为整个计算过程的瓶颈。这样推荐用户使用高带宽、低延迟的InfiniBand网络。

宝德典型的物理化学计算集群系统包括登录节点，计算节点，存储节点和交换系统，并且具有优异的性能和良好的扩展性。计算节点选用宝德高密度服务器平台，1U双路多节点服务器PR1720H，满足一般计算软件和计算任务的需求；计算系统还可以根据需要配置几台四路或八路SMP胖节点，专为Gaussian等OpenMP并行程序或其它一些大内存应用配备。集群系统配置了两台宝德PR2510V服务器作为管理登录节点，两台登录管理节点配置双机热备，对作业调度、用户管理等系统服务实现双保险，提高整个集群的高可用性。

计算网络采用高带宽、低延迟的QDRInfiniBand网络，为并行程序提供无阻塞的通信高速通道；另外，配置一套或两套千兆网络，用于集群管理和监控，千兆网络也可作为备用计算网络，提高系统的高可用性；存储系统采用宝德GS—5120FC/iSCSI—SAN磁盘阵列，提供了海量数据存储能力的同时，其创新的RAID级别提供了更高的数据保护功能。强大的硬件设计，灵活的扩展操作和友好的管理界面，为客户不同应用提供简单方便的解决方案。

本方案选择了业界领先的宝德PR7010B刀片服务器，采用最新的处理器架构，计算网络使用40Gb的QDRInfiniband，非常适合计算物理、计算化学这样的计算密集型和通信密集型应用；大容量、高性能、高容错、高可扩展性的分布式并行存储系统为集群提供了强大的存储支持。冗余电源，热插拔硬盘，高可靠的服务器存储系统等设备和技术保证系统的可靠稳定运行；双登录管理节点、备用计算网络、存储系统的高容错技术为集群的提供了更高的可靠性。

宝德物理化学计算HPC解决方案不仅保障现有条件下的高性能计算，并且绿色节能，实现弹性部署。系统设计为用户预留了自由的可扩展空间，用户可根据业务系统的增长，灵活地增配计算节点，扩充计算网络，提升计算性能；扩充存储系统的容量和性能，满足增长的数据存放和IO性能需求。另外集群还引入宝德PDCM智能功耗控制系统能够根据集群负载实时调整整个系统功耗，在不影响集群性能的情况下实现20%节能，真正实现绿色高效能计算。